2020年– date –
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オープンソースの電子ラボノートeLabFTWの概要と導入方法
電子ラボノートは各社から様々なものが出ていますが、主に「大規模企業・研究機関向けのパッケージ商品」「個人向け / 小規模施設向けのクラウドサービス」「オープンソースプロジェクト」に分類されます。 ここでは、オープンソースの電子ラボノートであ... -
クラウド上で電子ラボノートeLabFTWを実行する
クラウド上でeLabFTWを実行して、どこからでもアクセスできるようにしましょう。まずはeLabFTWを動かすためのクラウドサービスと契約する必要がありますが、ここではコストパフォーマンスと信頼性のバランスに優れたDigitalOceanを使ってみます。 DigitalO... -
Windowsのローカル環境で電子ラボノートeLabFTWを実行する
オープンソースで開発が進んでいる電子ラボノートのeLabFTWですが、基本的にはサーバー上にインストールして実行する必要があります。しかし、「ちょっと試してみたい」という場合にはサーバーまで準備するのは気が引けますよね?そのようなときは、Window... -
主要ながんゲノムデータベース
現在ではがんゲノム情報も網羅的に集積されるようになっており、それを公共データベースから誰でも閲覧し、解析することができるようになっています。 ここでは、主ながんゲノムデータベースについて紹介します。 [toc] ICGC Data Portal URL : https://dc... -
BNCT研究の現況と最新情報(NCT letter)が公開されています【BNCT】
日本中性子捕捉療法学会よりBNCT研究の現況と最新情報について詳細に書かれたNCT letter 第7号が公表されました。BNCTに関心のある方はぜひ一度ご覧ください。 NCT letter 第7号 保険診療が開始されて間もないBNCTですが、これまでの臨床の話や今後の新た... -
サンプルデータセット – scikit-learn①【Python】
機械学習モジュールのscikit-learnではサンプルデータが用意されており、それをDataFrameとして取り込むこともできます。機械学習のためのサンプルとして使うことはもちろんのこと、DataFrameとして取得すれば様々な解析に用いることができます。ここでは... -
matplotlibで散布図を描く【Python】
散布図は各データの項目の値を縦軸と横軸の2つに対応させてドットをプロットしていくことで、縦軸・横軸の2次元情報の相関関係やデータの分布を可視化するための図です。また、縦軸・横軸だけでなく、ドットの色もデータの値によって変化させることで3つの... -
COVID-19 オープンデータを可視化する①【Python】
各地のCOVID-19の感染者動向に関するオープンデータは東京都のGitHubリポジトリからフォークして提供されています。各地のデータは類似したフォーマットで提供されているので、そのデータを可視化してみましょう。ここでは、大阪府のデータを例にして説明... -
その日のページごとのPVやAdSense収益を見る! – アプリ版Googleアナリティクス
ブログを始めたばかりだと、どのページをどのくらいの人が見てくれているのかが気になりますよね?もちろん、Googleアナリティクスでページごとのアクセス数を調べられますが、Web版では地味に深い階層にあって調べにくいんですよね。しかも、Web版ではデ... -
matplotlibで折れ線グラフを描く【Python】
ここでは、最も基本となる折れ線グラフを描く方法を説明します。 開発環境 matplotlib 3.1.3 Pandas 1.0.3 Python 3.7.7 基本的な折れ線グラフの描画 Axesオブジェクトのplotメソッドで折れ線グラフを描画できます。(pyplotスタイルの場合は、pyplotのplot...