Alignment クラス (Bio.Blast.Record モジュール)
class Alignment(object)
インスタンス変数
hit_id
- BLAST検索でヒットした局所領域を含む配列を表すID <str>
hit_def
- BLAST検索でヒットした局所領域を含む配列の説明 <str>
hsps
- HSPオブジェクトのリスト <list(HSP)>
アラインメントのHigh Scoring Pair (HSP)をHSPオブジェクトのリストとして格納します。
length
- BLAST検索でヒットした局所領域を含む配列全体の配列長 <int>
title
- BLAST検索でヒットした局所領域を含む配列のタイトル <str>
titleはhit_idとhit_defの組み合わせで表現されます。
この値は、対応するDescriptionオブジェクトのtitle変数と一致します。