Biopython

Biopythonについて

Pythonでバイオデータ解析を行う際に必要になるライブラリとして、まずはBiopythonをインストールします。なお、ここではAnacondaがインストール済みである前提で話を進めます。(Anacondaのインストールはこちら)

Biopythonとは?

Biopythonでは配列データやアラインメントなど各種バイオデータのPythonオブジェクトが定義され、それらを扱うためのツールがまとめられたパッケージです。さらに、Biopythonにより各種のデータベースから直接データを取得したり、既存のデータ解析ツール(Embossなど)とPythonのプログラムを連携させることも可能になります。

※ Biopythonの主要ライブラリはこちら

Biopythonのインストール

BiopythonはAnacondaから以下のコマンドで簡単にインストール可能です

conda install biopython

Biopythonの使い方

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