Biopython
Pythonでバイオデータ解析を行う際に必要になるライブラリとして、まずはBiopythonをインストールします。なお、ここではAnacondaがインストール済みである前提で話を進めます。(Anacondaのインストールはこちら)
目次
Biopythonとは?
Biopythonでは配列データやアラインメントなど各種バイオデータのPythonオブジェクトが定義され、それらを扱うためのツールがまとめられたパッケージです。さらに、Biopythonにより各種のデータベースから直接データを取得したり、既存のデータ解析ツール(Embossなど)とPythonのプログラムを連携させることも可能になります。
Biopythonのインストール
BiopythonはAnacondaから以下のコマンドで簡単にインストール可能です 。(Biopython – Anaconda Cloud)
conda install biopython
Biopythonのライブラリ
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ライブラリ
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