_Ncbiblast2SeqCommandline クラス (Bio.Blast.Applications モジュール)

[APIドキュメント]

class _Ncbiblast2SeqCommandline(_NcbiblastCommandline)

継承関係：Application.AbstractCommandline → _NcbibaseblastCommandline → _NcbiblastCommandline → _Ncbiblast2SeqCommandline

NCBI BLAST+のラッパーのコマンドラインオブジェクトのための基底クラスです。

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特殊メソッド

__init__(cmd=None, **kwargs)

@ [APIドキュメント] ↑

**kwargsに指定する引数とBLASTコマンドのオプションとの対応は次のようになります。(source codeをもとに作成)

引数	コマンドオプション	データ型	デフォルト値	説明
gapopen	-gapopen
gapextend	-gapextend
subject	-subject
subject_loc	-subject_loc
culling_limit	-culling_limit
best_hit_overhang	-best_hit_overhang
best_hit_score_edge	-best_hit_score_edge