2020年– date –

C#のフレームワークには.NET Frameworkや.NET Core、Monoなどが乱立していて非常に複雑になっています。ここでは、それらの関係を明らかにして、今後の方向性を解説していきます。 .NETプラットフォームの構造 C#はマイクロソフトによる.NETの言語の一つで...

BLAST検索の結果はテキスト文書、タブ区切り、XML形式など選択できますが、プログラムによる解析を行うのであればXML形式が適しています。ここでは、XML形式で取得したBLAST検索結果の解析方法を説明します。 バイオインフォマティクス環境 以下の方法で構...

配列相同性検索のBLASTをPythonを用いて実行する方法を解説します。ここでは、特にウェブ版BLASTをPythonを用いて実行する方法の説明です。 バイオインフォマティクス環境 以下の方法で構築した環境であることを前提として説明します。 Windows10 + WSL (W...

個人で入手可能なものを使って自宅で細胞培養する方法を(勝手に)まとめてみました！ DIYバイオの中でも自宅で細胞培養するのは日本が進んでいるようです。特にShojinmeat Projectさんが培養肉の取り組みの一環として積極的にされているようです。では、自...

プロに頼むのではなくて自分で家具を作ったりするDIYに対して、いわゆる従来の大学・企業の研究室などではなく、自分たちの自宅や自作の研究室で細胞培養や生物研究をするのがDIYバイオです。ここでは、DIYとはどういうものかとその問題点などについてを説...

配列相同性検索のBLASTをPythonを用いて実行する方法を解説します。ここでは、特にローカルBLASTをPythonを用いて実行する方法の説明です。 バイオインフォマティクス環境 以下の方法で構築した環境であることを前提として説明します。 Windows10 + WSL (W...

BLASTによる配列相同性検索はバイオインフォマティクス解析の基本となっています。ここでは、BLASTについての基本的なことを説明します。 [toc] BLASTとは？ BLASTはNCBIによって公開されている配列相同性検索アルゴリズムであり、それを実装したアプリケ...

2020/6より頭頸部癌に対する加速器を用いたBNCTが保険収載されます。 保険適応となる条件は「薬事承認された医療機器及び医薬品を用いて、切除不能な局所進行又は局所再発の頭頸部癌の患者に対して実施した場合」に限られます。なお、ここでいう「薬事承認...

Biopythonでは配列データをSeqオブジェクトとして保持します。Seqオブジェクトとすることで、核酸配列の転写・翻訳などの遺伝子情報の操作に特有の操作を行うことが可能になります。 バイオインフォマティクス環境 以下の方法で構築した環境であることを前...

Markdown(マークダウン)記法は文章を記述するときの方法の1つで、簡単な方法で見栄えの良い文章を作ることができます。Markdownはテキストファイルとして書いていきますが、テキストファイルのままでも読みやすく、文章の構造もはっきりさせることができる...