ライブラリ

ライブラリ詳細

[APIドキュメント]

Bio.AffyAffymetrix(マイクロアレイ解析)に関連したデータ(celファイルなど)を扱うライブラリ
Bio.Align 配列アラインメントを扱うコードに関するライブラリ
Bio.AlignIO複数の配列アラインメントをオブジェクトとして入出力するライブラリ
Bio.Alphabet配列オブジェクトで使われるアルファベットについて配列のタイプなどを宣言するためのライブラリ (非推奨・削除予定)
Bio.ApplicationBiopythonからアプリケーションにアクセスするための仕組みを提供するライブラリ
Bio.BlastBLASTのプログラミングとその出力を扱うコードに関するライブラリ
Bio.Clusterクラスター解析に関するライブラリ
Bio.Dataバイオデータを扱うためのライブラリ
Bio.EmbossEMBOSSプログラムに関する有用なツールを提供するライブラリ
Bio.Entrezウェブを通してNCBIデータベースにアクセスするためのライブラリ
Bio.ExPASyウェブを通してExPASYデータベースにアクセスするためのライブラリ
Bio.FSSPFSSPファイルを扱うためのライブラリ
Bio.GenBankGenBankフォーマットファイルを扱うためのライブラリ
Bio.GeoNCBI GEOファイルを扱うためのライブラリ
Bio.Graphics解析結果の可視化をするためのライブラリ
Bio.KEGGKEGGデータベースにアクセスするためのライブラリ
Bio.LogisticRegressionロジスティック回帰のためのライブラリ
Bio.MedlineNCBI Medlineを扱うためのライブラリ
Bio.NMRNMRデータを扱うためのライブラリ
Bio.PDBPDBデータを扱うためのライブラリ
Bio.Pathwayパスウェイ解析に関わるライブラリ
Bio.Phylo系統樹を扱うためのライブラリ
Bio.PopGen集団遺伝学に関するライブラリ
Bio.Restriction制限酵素分析に関するライブラリ
Bio.SCOPタンパク質立体構造分類データベース(SCOP)を扱うためのライブラリ
Bio.SVDSuperimposerSVDを用いて、タンパク質構造を別のものにアラインメントするライブラリ
Bio.Seqアルファベットで記述された配列情報を表すオブジェクトを定義するライブラリ
Bio.SeqFeature配列データに埋め込まれたFeature情報を扱うライブラリ
Bio.SeqIOSeqRecordオブジェクトの入出力に関わるライブラリ
Bio.SeqRecordアノテーション付きの配列情報を表すオブジェクトを定義するライブラリ
Bio.SeqUtils配列データを扱うための各種ユーティリティ
Bio.Statistics基本的な統計処理を行うライブラリ
Bio.SubsMatSubstitution matrixやlog odds matrix、そしてそれらの演算を行うライブラリ
Bio.SwissProtSwissProtによるsprotXX.datファイルを扱うためのライブラリ
Bio.TogoWSDBCLSのウェブサービスであるTogoWSにアクセスするためのライブラリ
Bio.UniGeneUnigeneのHs.dataファイルのようなフォーマットの解析するためのライブラリ
Bio.UniProtUniProtファイルフォーマットを扱うためのライブラリ
Bio.WiseWise2パッケージツールの出力を扱うためのライブラリ
Bio.bgzfBGZF圧縮されたファイルを扱うためのライブラリ
Bio.codonalignコドンアラインメントを扱うためのライブラ
Bio.kNNk近傍法による分類をするためのライブラリ
Bio.motifs配列のモチーフ解析を行うためのライブラリ
Bio.pairwise2動的計画法を用いてペアワイズアラインメントを行うためのライブラリ
Bio.phenotypeフェノタイプデータの入出力を行うためのライブラリ

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