_Record クラス (vcf.model モジュール)
VCF形式におけるデータ領域のレコードを表すクラスです。1つの_Recordオブジェクトが1つの変異を表します。
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属性
ALT
- 変異部位のシークエンスデータ上での塩基配列 <list(_Substitution)>
CHROM
- 染色体番号 <str>
FILTER
- VCFファイルを作成する際に使用したフィルタリング条件を満たしているか <list>
FORMAT
- 個々のサンプルについてのデータ形式 <str>
ID
- 変異のID (dbSNPに登録されている変異なら、そのアクセッション番号) <str>
INFO
- 追加情報 <dict>
POS
- 変異のある塩基の位置 <int>
QUAL
- 変異部位のマッピングクオリティ値(検出ソフトによって算出方法が異なる) <int>
REF
- 変異部位のリファレンスゲノム上での塩基配列 <str>
samples
- VCFファイルに記録された各サンプルについての情報 <list(_Calls)>