HTSeq

HTSeq

HTSeqとは?

HTSeqはNGS関連の様々なデータ形式を扱うためのパーサーやクラスを提供するモジュールです。また、そのモジュールを使ったスクリプトとして遺伝子発現量カウントプログラム(htseq-count)なども提供しています。

HTSeqのインストール

Anacondaを用いて、以下のコマンドでインストール可能です。(HTSeq – Anaconda Cloud)

conda install -c bioconda htseq

なお、Anacondaについては以下の記事をご覧ください。

HTSeqのライブラリ