HTSeq
目次
HTSeqとは？
HTSeqはNGS関連の様々なデータ形式を扱うためのパーサーやクラスを提供するモジュールです。また、そのモジュールを使ったスクリプトとして遺伝子発現量カウントプログラム(htseq-count)なども提供しています。
HTSeqのインストール
Anacondaを用いて、以下のコマンドでインストール可能です。(HTSeq – Anaconda Cloud)
conda install -c bioconda htseq
なお、Anacondaについては以下の記事をご覧ください。
あわせて読みたい
Anacondaによるデータ解析環境の構築
【Anacondaとは？】 パッケージ管理システムのcondaとPython、そして科学計算処理(データサイエンスや機械学習など)に必要なパッケージをすべてまとめたものがAnaconda...