- TCGAデータベースを用いたRNA-Seq ― 遺伝子発現量の取得【Python】がんゲノムデータベースのGDC Data Portal (TCGAデータベース)には様々な癌種の臨床情報からゲノムデータまでが格納されています。純粋なドライな研究としてもウェットの研究の前段階としても …
- WinUI 3.0 のクラスライブラリを覗いてみる【UWP】UWPアプリのGUIと従来からあるデスクトップアプリのGUIを統合する試みとしてProject Reunionがありますが、その目玉のAPIであるWinUI 3.0のAPIも公開されて徐々に全貌が見え …
- 遺伝子発現量カウントの補正方法(RPM, RPKM, TPM)【Python】RNA-Seqにおける遺伝子発現量カウントは遺伝子長やリード数などで補正をする必要があります。ここではその補正方法として、RPM/FPM、RPKM/FPKM、TPMについて説明し、Pythonを用いた …
- GDC Data Portal (TCGA) のデータを取得するがんゲノムデータベースの一つであるGDC Data Portal (TCGA)からは様々なゲノムデータを取得することができ、がん研究に携わる人は必ず使いこなさないといけない必須スキルとすら言えます。こ …
- htseq-countを用いた遺伝子発現量のカウント【Python】RNA-Seqのシークエンスデータをマッピングし、それぞれの遺伝子領域にいくつのリードがマッピングされたかをカウントすることで遺伝子発現量を定量化することができます。マッピングファイルから遺伝子発現量 …
- Windows10のMS-IMEで「かな」「英数」キーを割り当てる方法【Windows】Windowsユーザーなら、日本語の文書を書こうとして入力したのにIMEがオフで半角の英字が入力されてしまったり、英語の文書を入力しようとしているのに日本語入力になってしまってイライラした経験は必ずあ …
ライフサイエンス研究にITの力を！