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# BioTech ラボ・ノート

ライフサイエンス研究にITの力を！

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- [確率・オッズ・ロジットの関係からオッズ比、ロジスティック回帰モデルまで](https://biotech-lab.org/articles/4859)
- [matplotlibで箱ひげ図を描く【Python】](https://biotech-lab.org/articles/4978)
- [matplotlibで日本語を表示する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/10885)
- [ロジスティック回帰モデル：細胞診結果から乳房腫瘍の良性/悪性を予測する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/13960)
- [グラフの軸の設定【Python】](https://biotech-lab.org/articles/1651)
- [matplotlibで折れ線グラフを描く【Python】](https://biotech-lab.org/articles/4973)
- [matplotlibにおける２つのグラフ作成スタイル【Python】](https://biotech-lab.org/articles/1537)
- [DataFrameの作成【Python】](https://biotech-lab.org/articles/1312)
- [DataFrameにマルチインデックスを設定する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/1487)
- [DataFrameから条件を指定してデータを抽出する方法(queryメソッド)【Python】](https://biotech-lab.org/articles/6149)
- [画像の読み込み・保存【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/1194)
- [CLRオブジェクトに対するLINQ【C#】](https://biotech-lab.org/articles/8868)
- [ジェネリック【C#】](https://biotech-lab.org/articles/3881)
- [拡張メソッド【C#】](https://biotech-lab.org/articles/8762)
- [匿名メソッドとラムダ式【C#】](https://biotech-lab.org/articles/8683)
- [メソッドとそれに準じる構造【C#】](https://biotech-lab.org/articles/4286)
- [クラス【C#】](https://biotech-lab.org/articles/3940)
- [DigitalOceanのクラウドサーバーにSSHで接続する](https://biotech-lab.org/articles/5791)
- [DataFrameから条件を指定してデータを抽出する方法(ブールインデックス参照)【Python】](https://biotech-lab.org/articles/6171)
- [ndarrayから条件を満たす要素を抽出する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/12701)
- [デリゲートとイベント【C#】](https://biotech-lab.org/articles/7709)
- [「バイオインフォマティクス技術者認定試験」傾向と対策(2021年度版)](https://biotech-lab.org/articles/7793)
- [DataFrameのデータ要約(記述統計量の取得)【Python】](https://biotech-lab.org/articles/1453)
- [scikit-learnにおけるデータセットの形式：Bunchクラスの扱い方【Python】](https://biotech-lab.org/articles/13755)
- [ゲーム全体の進行を管理するマネージャークラスを作成する【Unity】](https://biotech-lab.org/articles/4519)
- [XMLの基本文法 ― XAMLの理解のために【C#/XAML】](https://biotech-lab.org/articles/8454)
- [UpdateメソッドとFixedUpdateメソッドの使い分け【Unity】](https://biotech-lab.org/articles/4434)
- [ブログ開設1年の経過報告 ― 現状と今後の抱負](https://biotech-lab.org/articles/7505)
- [技術ブログ開設６か月の経過報告 ― 技術ブログのリアル](https://biotech-lab.org/articles/3308)
- [技術ブログを２年放置した結果... (アクセス数の推移など)](https://biotech-lab.org/articles/19928)
- [C#の主な実装【C#】](https://biotech-lab.org/articles/3915)
- [SARS-CoV-2のゲノムデータを入手する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/2241)
- [Pythonを用いたNCBIデータベースへのアクセス【Python】](https://biotech-lab.org/articles/2275)
- [WindowsユーザーのためのPythonを用いたゲノム解析環境【Python】](https://biotech-lab.org/articles/2960)
- [DataFrameにメタデータを加える【Python】](https://biotech-lab.org/articles/13321)
- [学習用データセット - seaborn【Python】](https://biotech-lab.org/articles/1408)
- [DataFrameの行・列の追加【Python】](https://biotech-lab.org/articles/1335)
- [ロジスティック回帰分析【Python】](https://biotech-lab.org/articles/14017)
- [分割表における独立性の検定を行う(カイ二乗検定)【Python】](https://biotech-lab.org/articles/8182)
- [Seriesの作成とその活用【Python】](https://biotech-lab.org/articles/11919)
- [2群の生存確率関数の差の検定(ログランク検定・一般化Wilcoxon検定)【Python】](https://biotech-lab.org/articles/8314)
- [比例ハザードモデルを用いたCox回帰分析【Python】](https://biotech-lab.org/articles/14450)
- [DataFrameの各列間の相関係数を求める(相関行列)【Python】](https://biotech-lab.org/articles/13962)
- [matplotlibで散布図を描く【Python】](https://biotech-lab.org/articles/4905)
- [サンプルデータセット - scikit-learn①【Python】](https://biotech-lab.org/articles/5289)
- [GDC Data Portal (TCGA) のデータを取得する](https://biotech-lab.org/articles/6985)
- [DataFrameの結合【Python】](https://biotech-lab.org/articles/7232)
- [非エンジニア向けのMarkdown記法入門](https://biotech-lab.org/articles/3211)
- [実験ノートの電子化 (電子ラボノート)](https://biotech-lab.org/articles/4)
- [Numpy.NETを導入する【C#】](https://biotech-lab.org/articles/12849)
- [静脈ルート確保の方法を数学的に考察する ― 理屈っぽい貴方のために(新人Dr. / Ns.向け)](https://biotech-lab.org/articles/7685)
- [DICOM規格のサンプルデータを入手する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/2443)
- [seabornでヒートマップを描く【Python】](https://biotech-lab.org/articles/14980)
- [グラフタイトルの設定【Python】](https://biotech-lab.org/articles/1638)
- [MS Excelファイル (xls形式、xlsx形式) のDataFrameへの読み込み・書き込み【Python】](https://biotech-lab.org/articles/4723)
- [正規分布に従う乱数を生成する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/13652)
- [テキストファイルの読み込み・書き込み【C#/WinRT】](https://biotech-lab.org/articles/18688)
- [クリップボードを使う【C#/WinRT】](https://biotech-lab.org/articles/18183)
- [ファイル・フォルダ選択ダイアログを表示させる【C#/WinRT】](https://biotech-lab.org/articles/18040)
- [TabViewを導入する【C#/XAML】](https://biotech-lab.org/articles/16846)
- [画像を表示する【C#/XAML】](https://biotech-lab.org/articles/18690)
- [OpenCVの座標系と画素値【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/872)
- [DataFrameを1行ずつ処理する(forループ)【Python】](https://biotech-lab.org/articles/10669)
- [MS Accessファイル (accdb形式) へのアクセス【Python】](https://biotech-lab.org/articles/4532)
- [近似曲線と決定係数(R2)の算出【Python】](https://biotech-lab.org/articles/4907)
- [背景画像に別の画像をはめ込む【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/13415)
- [コントロールを移動・変形させる【C#/XAML】](https://biotech-lab.org/articles/18961)
- [DataFrameの成分へのアクセス【Python】](https://biotech-lab.org/articles/1357)
- [Anacondaによるデータ解析環境の構築](https://biotech-lab.org/articles/328)
- [研究者の評価指標（h-indexとインパクトファクター）](https://biotech-lab.org/articles/6555)
- [ダイアログメッセージを表示する【C#/XAML】](https://biotech-lab.org/articles/19296)
- [画像の表示【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/13431)
- [頭頸部癌に対するBNCTの保険診療が開始されます【BNCT】](https://biotech-lab.org/articles/4623)
- [NavigationViewを導入する【C#/XAML】](https://biotech-lab.org/articles/15235)
- [Frame内でPageを遷移させる(ナビゲーション)【C#/XAML】](https://biotech-lab.org/articles/15529)
- [XAMLの基本文法【C#/XAML】](https://biotech-lab.org/articles/8442)
- [データバインディング【C#/XAML】](https://biotech-lab.org/articles/8346)
- [CommandBarを配置する【C#/XAML】](https://biotech-lab.org/articles/15228)
- [Windows標準カレンダーの操作【C#/WinRT】](https://biotech-lab.org/articles/19014)
- [基本的なファイル操作【C#/WinRT】](https://biotech-lab.org/articles/18720)
- [基本的なフォルダ操作【C#/WinRT】](https://biotech-lab.org/articles/18892)
- [コード上から実行した外部プログラムの標準出力を読み込む【C#】](https://biotech-lab.org/articles/10000)
- [線形回帰モデル：診察データから1年後の糖尿病の進行度を予測する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/13745)
- [matplotlibで棒グラフを描く【Python】](https://biotech-lab.org/articles/10875)
- [カテゴリ変数を数値に置き換える【Python】](https://biotech-lab.org/articles/14290)
- [BNCTの保険承認を振り返る：審査報告書をもとに【BNCT】](https://biotech-lab.org/articles/11165)
- [カプラン・マイヤー推定量と生存率曲線【Python】](https://biotech-lab.org/articles/6361)
- [ndarrayの要素をヒストグラムで俯瞰する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/13613)
- [アフィン変換【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/13417)
- [ndarrayの要素を条件に応じて置き換える【Python】](https://biotech-lab.org/articles/13051)
- [ndarrayをバイナリ形式でファイルに保存する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/12689)
- [WinUI 3.0とProject Reunion【C#】](https://biotech-lab.org/articles/3457)
- [正規表現を使って検索・置換する ― 基本編【Python】](https://biotech-lab.org/articles/11916)
- [DigitalOcean上にPython環境を用意する](https://biotech-lab.org/articles/11688)
- [DigitalOceanのインスタンスにDocker環境を構築する](https://biotech-lab.org/articles/5842)
- [正規母集団の母平均の区間推定を行う【Python】](https://biotech-lab.org/articles/4984)
- [eLabFTWのアップデート](https://biotech-lab.org/articles/5592)
- [COVID-19 オープンデータを可視化する③：政府CIOポータルのワクチン接種状況【Python】](https://biotech-lab.org/articles/11229)
- [複数のグラフの配置【Python】](https://biotech-lab.org/articles/2032)
- [マルチインデックスが設定されたDataFrameの統計量の取得【Python】](https://biotech-lab.org/articles/1508)
- [COVID-19 オープンデータを可視化する②：ワクチン接種状況の可視化【Python】](https://biotech-lab.org/articles/10440)
- [PythonスクリプトからWordPressを操作する(導入編) - XML-RPC【Python】](https://biotech-lab.org/articles/11276)
- [二値化画像から関心領域(ROI)の輪郭を検出する【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/10906)
- [画像の色空間の変換【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/10150)
- [今行えるBNCTによるがん治療 (2020/7/28 現在)【BNCT】](https://biotech-lab.org/articles/4866)
- [OpenCV-Pythonにおけるデータ構造【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/844)
- [グラフに凡例を追加する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/10877)
- [COVID-19 オープンデータを可視化する①【Python】](https://biotech-lab.org/articles/5198)
- [UWPアプリにPythonでコーディングした処理を組み込む【UWP】](https://biotech-lab.org/articles/9985)
- [「Python-UWP サンプルアプリ」をMicrosoft Storeに提出する【UWP】](https://biotech-lab.org/articles/10590)
- [新規イメージの作成【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/1159)
- [FullTrustProcessとして起動したランチャーを介して外部プログラムを実行する【UWP】](https://biotech-lab.org/articles/10392)
- [コード上から外部プログラムを実行してそのプロセスを取得する【C#】](https://biotech-lab.org/articles/9998)
- [クリップボードを介してUWPアプリと外部プログラムを連携させる【UWP】](https://biotech-lab.org/articles/10347)
- [外部プログラムに引数を渡して実行する【UWP】](https://biotech-lab.org/articles/10377)
- [UWPアプリから外部のexeファイルを実行する【UWP】](https://biotech-lab.org/articles/9884)
- [基本図形の描画３ - 多角形・折れ線【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/1251)
- [基本図形の描画２ - 円・楕円・矩形【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/944)
- [基本図形の描画１ - 線分・矢印・マーカー・文字【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/949)
- [オープンソースの電子ラボノートeLabFTWの概要と導入方法](https://biotech-lab.org/articles/5452)
- [Windowsのローカル環境で電子ラボノートeLabFTWを実行する](https://biotech-lab.org/articles/5418)
- [クラウド上で電子ラボノートeLabFTWを実行する](https://biotech-lab.org/articles/5466)
- [eLabFTWのデータを移行する](https://biotech-lab.org/articles/5508)
- [eLabFTWの高度な設定を行う（タイムゾーンの変更）](https://biotech-lab.org/articles/5594)
- [SMTP2GOを用いたメール送信サーバーの設定](https://biotech-lab.org/articles/5598)
- [eLabFTWのデータ構造とバックアップ・復元](https://biotech-lab.org/articles/5638)
- [eLabFTW の活用方法 ― 実際の使用例を公開します！](https://biotech-lab.org/articles/7692)
- [Pythonスクリプトを実行形式(exeファイル)に変換する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/9856)
- [よく使う conda コマンド一覧](https://biotech-lab.org/articles/818)
- [非同期処理【C#】](https://biotech-lab.org/articles/9719)
- [Outlookカレンダー(クラウド版)の予定表を取得・新規作成する【C#】](https://biotech-lab.org/articles/9309)
- [Outlookカレンダー(クラウド版)のイベント一覧をリストとして取得する【C#】](https://biotech-lab.org/articles/9578)
- [Outlookカレンダー(クラウド版)のイベントを新規作成する【C#】](https://biotech-lab.org/articles/9581)
- [Outlookカレンダー(クラウド版)のイベントを更新・削除する【C#】](https://biotech-lab.org/articles/9583)
- [Microsoft Graph .NET Client Libraryの基本的な使い方【C#】](https://biotech-lab.org/articles/9318)
- [UWPアプリからMicrosoft Graphのユーザー認証を行う【C#】](https://biotech-lab.org/articles/9029)
- [タイマーを用いて一定間隔で処理を繰り返す【C#】](https://biotech-lab.org/articles/8932)
- [2群間の母平均の差の検定を行う(t検定)【Python】](https://biotech-lab.org/articles/6349)
- [多群間の等分散性の検定を行う(バートレット検定・ルビーン検定)【Python】](https://biotech-lab.org/articles/6354)
- [WinUI 3.0 のクラスライブラリを覗いてみる【C#】](https://biotech-lab.org/articles/7249)
- [分布の適合度検定を行う(カイ二乗検定)【Python】](https://biotech-lab.org/articles/6358)
- [DigitalOcean App Platformを用いたWebアプリの開発](https://biotech-lab.org/articles/7467)
- [TCGAデータベースを用いたRNA-Seq ― 遺伝子発現量の取得【Python】](https://biotech-lab.org/articles/7292)
- [htseq-countを用いた遺伝子発現量のカウント【Python】](https://biotech-lab.org/articles/6846)
- [遺伝子発現量カウントの補正方法(RPM, RPKM, TPM)【Python】](https://biotech-lab.org/articles/7045)
- [主要ながんゲノムデータベース](https://biotech-lab.org/articles/369)
- [ゲノムアノテーションファイル(GFF3形式)の基本操作【Python】](https://biotech-lab.org/articles/6836)
- [Windows10のMS-IMEで「かな」「英数」キーを割り当てる方法【Windows】](https://biotech-lab.org/articles/6931)
- [ショートカット？シンボリックリンク？ - ファイル・フォルダにリンクを張る方法【Windows】](https://biotech-lab.org/articles/582)
- [Windows環境でのゲノムデータの取得【Python】](https://biotech-lab.org/articles/3054)
- [バリアントコールファイル(VCF形式)の基本操作【Python】](https://biotech-lab.org/articles/6744)
- [FASTQ形式の配列データの品質をPythonでチェックしてみる【Python】](https://biotech-lab.org/articles/6367)
- [マッピングファイル(SAM/BAM/CRAM形式)の基本操作【Python】](https://biotech-lab.org/articles/6371)
- [自分のゲノムデータを公開している人たち](https://biotech-lab.org/articles/6391)
- [リファレンスゲノム配列(GRCh38/hg38)と日本人基準ゲノム配列(JG2)](https://biotech-lab.org/articles/6389)
- [1000人ゲノムプロジェクトからデータを取得する](https://biotech-lab.org/articles/6385)
- [塩基配列の操作【Python】](https://biotech-lab.org/articles/326)
- [シークエンスデータのファイル形式とBiopythonオブジェクト【Python】](https://biotech-lab.org/articles/3133)
- [実験データの外れ値を統計学的に判別する方法](https://biotech-lab.org/articles/4954)
- [DataFrame / Series からリストに変換する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/4896)
- [OneNoteを使った書籍の電子化 ― 紙の本のよさをそのままに](https://biotech-lab.org/articles/5947)
- [DigitalOceanでマインクラフト統合版のサーバーを立てる](https://biotech-lab.org/articles/5895)
- [非エンジニア向けのGitHub活用法 (特にライフサイエンス分野)](https://biotech-lab.org/articles/160)
- [BNCT研究の現況と最新情報（NCT letter）が公開されています【BNCT】](https://biotech-lab.org/articles/5369)
- [COVID-19 感染者動向に関するオープンデータ【Python】](https://biotech-lab.org/articles/2163)
- [その日のページごとのPVやAdSense収益を見る！ - アプリ版Googleアナリティクス](https://biotech-lab.org/articles/5142)
- [PCR検査陽性で実際にコロナに罹っている確率は？ ― 感度・特異度・適中率の関係](https://biotech-lab.org/articles/4752)
- [BNCTの過去・現在・未来 - 日本が世界をリードするがん治療【BNCT】](https://biotech-lab.org/articles/237)
- [BNCT(ホウ素中性子捕捉療法)とは？ - BNCTの原理と他の治療法との比較【BNCT】](https://biotech-lab.org/articles/221)
- [加速器BNCT治療システムが医療機器として承認される見込みになりました！【BNCT】](https://biotech-lab.org/articles/645)
- [加速器を用いたBNCT治療システムが医療機器・医薬品の製造販売承認を獲得しました【BNCT】](https://biotech-lab.org/articles/4616)
- [京都大学の原子炉を用いた医療照射は終了しました【BNCT】](https://biotech-lab.org/articles/4635)
- [他のスクリプトの変数・メソッドにアクセスする【Unity】](https://biotech-lab.org/articles/4376)
- [スクリプトからのGameObjectの基本的操作（座標・回転・色の指定）【Unity】](https://biotech-lab.org/articles/4280)
- [matplotlibでの画像の表示【Python】](https://biotech-lab.org/articles/2074)
- [matplotlibにおけるテキストの表示・設定【Python】](https://biotech-lab.org/articles/1671)
- [DataFrameの行数・列数を取得する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/1403)
- [PythonでBLASTする！（BLAST結果のXML解析）【Python】](https://biotech-lab.org/articles/3545)
- [PythonでBLASTする！（ウェブ版BLASTの実行）【Python】](https://biotech-lab.org/articles/3432)
- [PythonでBLASTする！（ローカルBLASTの実行）【Python】](https://biotech-lab.org/articles/2958)
- [PythonでBLASTする！（基礎編：BLASTとは？）【Python】](https://biotech-lab.org/articles/3422)
- [OpenCV-Pythonについて【OpenCV】](https://biotech-lab.org/articles/799)
- [DICOMファイルから画像とメタデータを取得する【Python】](https://biotech-lab.org/articles/2391)
- [DICOM-RT形式を読み込む - プラン編【Python】](https://biotech-lab.org/articles/2517)
- [Unityスクリプトの基礎【Unity】](https://biotech-lab.org/articles/3870)
- [物理エンジンとUnity - リアルタイム3D開発プラットフォーム【Unity】](https://biotech-lab.org/articles/4356)
- [スクリプトからのRigidbodyの操作【Unity】](https://biotech-lab.org/articles/4350)
- [スクリプトからのGameObjectの動的生成 ― 初めてのUnityスクリプト作成【Unity】](https://biotech-lab.org/articles/4241)
- [Canvasの基本的な設定と使い方【Unity】](https://biotech-lab.org/articles/4430)
- [ゲーム画面上のテキストをスクリプトから操作する【Unity】](https://biotech-lab.org/articles/4485)
- [UWPアプリの公式広告プラットフォームの廃止](https://biotech-lab.org/articles/2892)
- [DIYバイオとは？](https://biotech-lab.org/articles/3673)
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- [Microsoft.UI.Xaml 名前空間](https://biotech-lab.org/tech-info/cs-gui/winui/microsoft-ui-xaml)
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- [PyVCF](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/pyvcf)
- [vcf.model モジュール](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/pyvcf/library/vcf-model)
- [_Call クラス](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/pyvcf/library/vcf-model/_call-class)
- [Reader クラス](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/pyvcf/library/vcf/reader-class)
- [AlignmentFile クラス](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/pysam/library/pysam/alignmentfile-class)
- [vcf モジュール](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/pyvcf/library/vcf)
- [AlignedSegment クラス](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/pysam/library/pysam/alignedsegment-class)
- [pysam モジュール](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/pysam/library/pysam)
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- [_NcbibaseblastCommandline クラス](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/biopython/library/bio-blast/applications/ncbibaseblastcommandline-class)
- [AbstractCommandline クラス](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/biopython/library/bio-application/abstractcommandline-class)
- [Bio.Application モジュール](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/biopython/library/bio-application)
- [Bio.SeqIO モジュール](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/biopython/library/bio-seqio)
- [Bio.SeqRecord モジュール](https://biotech-lab.org/tech-info/python-bioinformatics/biopython/library/bio-seqrecord)
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